مطالعه تنوع ژنتیکی در جمعیت های ایرانی قارچ Erysiphe betae(Vanha) Weltzien عامل بیماری سفیدک سطحی چغندر با روش rDNA-RFLP

نوع مقاله : کامل علمی - پژوهشی

نویسندگان

1 گروه گیاهپزشکی،دانشکده کشاورزی دانشگاه تهران-ایران

2 آزمایشگاه فیتوتکنولوژی،دانشگاه علوم کاربردی هایلبرون واینزبرگ-آلمان

چکیده

در این مطالعه 105 جدایه قارچ عامل سفیدک سطحی چغندرقند از مناطق مختلف کشور جمعﺁوری و مورد بررسی قرار گرفت.استخراج DNA از آسکوکارپﻫا با استفاده از محلول پنج درصد  Chelex100 انجام شد.نواحی فاصلهﺳاز بین ژنﻫای ریبوزومی به همراه قطعه  S 8/5 توسط آغازگرهایITS1وITS4 از طریق واکنش زنجیره ای پلیمراز تکثیر شده و روی آگارز 5/1 درصد ارزیابی گردیدند.محصول PCRتمام جدایهﻫا شامل یک قطعه با بزرگی  645 جفت بازی بود. محصولات PCR به وسیله نه آنزیمﺑرشی EcoRI, MspI,SacI, HaeIII, AluI, TaqI, HindIII, CfoI,وRsaI  هضم ومحصولات هضم روی ژل اکریلامید%5/7 تفکیک گردیدند.نتایج نشان داد که فقط چهار آنزیمﺑرشی CfoI, HaeIII, AluI, MspIدارای محل برش روی قطعه مزبور بودند.آنزیم  AluIدر دفعات مختلف باندهای متغیری پدید آورد ونتایج آن لحاظ نگردید.آنزیمCfoI بادو محل تشخیص سه قطعه با طولﻫای280،185 و180 جفت باز را تولید کرد.محصول هضم آنزیمMspI چهار قطعه با بزرگی 325،160،120و40 جفت باز بود.آنزیمHaeIII پس از هضم محصولات PCR پنج قطعه با اندازهﻫای 325،180،75،40و30 جفت باز تولید کرد.بین نقوش باندی محصولاتPCR ومحصولات هضم آنزیمی هریک از آنزیمﻫا برای تمام جدایهﻫای بررسی شده تفاوتی مشاهده نشد.نتایج نشان داد که جمعیتﻫای ایرانی قارچ عامل سفیدک سطحی چغندر از یکنواختی بسیار بالایی برخوردار هستند.

کلیدواژه‌ها

عنوان مقاله [English]

A study on genetic diversity of Iranian populations of Erysiphe betae(Vanha) Weltzien causal agent of sugar beet powdery mildew using rDNA-RFLP method

نویسندگان [English]

  • M. Sheikholeslami 1
  • M. Okhovvat 1
  • Gh. Hejaroude 1
  • A. Sharifi-Tehrani 1
  • M. Seidel 2
  • M. Javan-Nikkhah 1
1 Department of Plant Protection. College of Agriculture, University of Tehran, Iran
2 Phytotechnology Lab. University of Applied Sciences of Heilbronn, Weinsberg, Germany
چکیده [English]

A total of 105 isolates of Erysiphe betae from different regions of Iran were investigated. For probable polymorphism of ITS-5.8S regions using PCR-based RFLP, the mentioned fragments were amplified via PCR by ITS1 and ITS4 primers and subjected to 1.5% agarose gel electrophoresis. PCR products were digested by HaeIII, AluI, TaqI, HindIII, CfoI, EcoRI, MspI, SacI and RsaI REs and the digestion products were resolved on 7.5% polyacrylamide. PCR product of all isolates was only one 645 bp fragment. Among nine REs tested AluI, CfoI, MspI and HaeIII had recognition sequences on PCR products. Because of unstability, results for AluI were ignored.Digestion products for CfoI were 280, 185 and 180bp, for MspI, 325, 160, 120 and 40bp and those of HaeIII, 325, 180, 75, 40 and 30bp fragments for all isolates. Electrophoretic patterns of  PCR products and digested products were completely similar,thus no polymorphism was discernible between 105 isolates. Based on the results,Iranian populations of E.betae seems to be highly uniform.    

کلیدواژه‌ها [English]

  • Genetic diversity
  • Iranian Populations
  • Powdery mildew
  • rDNA-RFLP
  • sugar beet
  • Erysiphe betae

فایل ها

هم رسانی

ارجاع به این مقاله

آمار