تنوع بیماری‌زایی و ژنتیکی جدایه‌های Fusarium solani و ارتباط آن با پوسیدگی ریشه چغندرقند

نوع مقاله : کامل علمی - پژوهشی

نویسندگان

1 دانش آموخته کارشناسی ارشد رشته بیماری‌شناسی گیاهی دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات

2 استاد دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات- تهران، ایران

3 استادیار مؤسسه تحقیقات اصلاح و تهیه بذر چغندرقند، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران.

چکیده

از ریشه‌های چغندرقند دارای علائم پوسیدگی، از مناطق چغندرکاری مختلف کشور، یکصد جدایه قارچی جداسازی شد. از بین آن‌ها، 20 جدایه براساس خصوصیات ریخت‌شناسی متعلق به  F. solaniبودند. بیماری‌زایی جدایه‌ها در شرایط آزمایشگاه روی ریشه‌های چغندرقند انجام شد. جدایه‌های مورد بررسی به گروه‌های بیماری‌زا، بیماری‌زایی کم و غیر‌بیماری‌زا دسته‌بندی شدند. جدایه‌های F. solani در گلخانه روی بوته‌های 14 هفته‌ای قادر به ایجاد بیماری نبودند اما روی ریشه‌های زخم شده علائم بیماری را نشان دادند. تنوع ژنتیکی 20 جدایه F. solani با روش  ITS-rDNA با کمک جفت آغازگرهای ITS 1/4 مطالعه شد. آغازگرهای مذکور در تمام جدایه‌ها منجربه تکثیر قطعات DNA شدند. جدایه‌ها با توجه به الگوی نواری به سه گروه یک نواری (550 یا 600 جفت باز)، دو نواری(550 و 600 جفت باز) و سه نواری (500،550و 600 جفت باز) تقسیم‌بندی شدند. برش محصولات تکثیری با آنزیم‌های برشی Msp1,EcoR1,BamH1 نشان داد که آنزیم  BamH1فاقد محل برش در قطعات تکثیری بود. الگوی حاصل‌از آنزیم  EcoR1 برای همه جدایه‌ها یکسان بود و این آنزیم دارای یک محل برش در کلیه جدایه‌ها بود. برای الگوی برش آنزیم Msp1 جدایه‌ها دارای تنوع بودند. در برخی از جدایه‌ها یک محل برش و در برخی دیگر بیش از یک محل برش وجود داشت. ارتباطی بین بیماری‌زایی، منطقه جغرافیایی و تنوع حاصل از آنالیز ITS-rDNA مشاهده نشد.

کلیدواژه‌ها


عنوان مقاله [English]

Pathogenic variability and genetic diversity of Fusarium solani isolates and its association with sugarbeet root rot

نویسندگان [English]

  • S. Ashena 1
  • H. R. Zamanizadeh 2
  • S. B. Mahmoodi 3
1 MSc. graduated in Islamic Azad University , Science and Research Branch , Iran
2 Professor of Islamic Azad University , Science and Research Branch ,Tehran, Iran
3 Assistant Professor of Sugar Beet Seed Institute (SBSI) - Agricultural Research Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran
چکیده [English]

Diseased samples with root rot symptoms were collected from different sugar beet growing areas. From rotted roots, 20 fungal isolates were identified as Fusarium solani based on morphological characteristics .Pathogenecity of the isolates was studied in in vitro condition on sugar beet roots. The results showed pathogenic variability among the isolates. Cluster analysis divided the isolates into three pathogenic, moderate pathogenic and non-pathogenic groups. In pathogenicity test on 14 week old sugar beet plants no symptoms was observed in greenhouse conditions but the symptoms appeared on exposed roots .Genetic diversity of the isolates was studied using ITS4 and ITS5 primers through PCR-RFLP. Banding patterns of the isolates divided them into three groups including isolates with a single band (550 or 600 bp.), double band (550 and 600 bp.) and triple band (500, 550, and 600). PCR products of the isolates were digested with Msp1, EcoR1 and BamH1 restriction endonucleases. The results showed that BamH1 enzyme had no restriction site. DNA patterns of the isolates digested by EcoR1 were the same among all isolates and produced double monomorphic fragments for all isolates. Digestion with Msp1 showed intraspecific genetic diversity among different isolates of F.solani. The results didn’t show any relation among pathogenecity test, geographic location and ITS-rDNA analysis of the fungal isolates.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Digestion enzyme
  • Fusarium solani
  • isolate
  • ITS-rDNA
  • pathogenic variability